國產固相萃取儀和液－液萃取相比，其長處在于方便和消耗試劑少，短處在于批次間的重復性難以保證。出現這種情況的原因在于：液體試劑的重復性好，只要其純度可靠，不同年代的產品的物理化學性質都是可靠的。而國產固相萃取儀劑就算保證了純度外，還存在著顆粒度的差異，外形的差異等液體試劑不存在的且難以衡量的因素，不同年代不同批號的萃取性質可能會有較大的區別。

　　從理論上和廠家宣傳來看，固相萃取應該在色譜分析的前處理上得到很好的應用：有機溶劑用得很少，可批量處理樣品，既可富集，又能除雜質，給人印象是前處理的革命性進步。然而現實情況，起碼在國內，雖然推廣了多年，國產固相萃取儀實際應用還是相當有限。SPE應用得不廣，與我們的使用方式和期望有關，也與它本身的局限有關。對于供應商來說，從經濟利益出發，向來都是忽略固相萃取的局限與不足。固相萃取可以作為前處理手段的個很好補充，但是在使用時，定要清醒知道到它的優點和缺點，注意因地制宜，揚長避短。

　　國產固相萃取儀為了從水溶液中將化合物吸引到離子交換樹脂上，樣品的pH值定要保證其分離物的官能團和鍵合硅膠上的官能團均帶電荷。如果某種離子帶有與分析物樣的電荷，它將會干擾分析物的吸附。當然這種情況也可能是罕見的。洗脫溶液般是其pH值能中和分離物官能團上所帶電荷，或者中和鍵合硅膠上官能團所帶電荷。當官能團上的電荷被中和，靜電吸引也就結束，分析物則隨之洗脫。另外，洗脫溶液也可能是種其離子強度很大或含有另種離子能取代被吸附的化合物，這樣被吸附的化合物也隨之而洗脫。如果非性溶劑不能有效地從國產固相萃取儀填料上洗脫化合物，就有必要加些性溶劑（如甲醇），以破壞性相互作用而保留的化合物。在這種情況下，甲醇與硅膠上的羥基形成氫鍵，打斷了分析物與硅膠上的羥基形成的氫鍵。

　　對于鍵合硅膠上國產固相萃取儀過程，如果希望保留分析物，預處理的溶液和樣品（基本上或全部為水溶液）的pH應調至適宜分析物保留。如果，分析物是酸或堿性的，通常情況下，使用的pH應該阻止化合物帶電荷。中性化合物（無酸性和堿性基團）的保留，般不受pH影響。相反，也能調節pH，使樣品中不需要的化合物保留在固相萃取的填料上，而分析物則不被保留而流出。國產固相萃取儀在適當的pH，分析物的再次親水性和陽離子交換作用則能被利用。